Essa comunidade era a princípio habitada pelos índios Guarani e Kaingang margeando o rio que mais tarde veio dar o nome a então comunidade, "Chapecózinho". O rio por conseguinte era muito utilizado pois servia de passagem de balsa ao viajantes que vinham do Paraná com destino ao litoral e ao Rio Grande do Sul. Essas mesmas terras serviam ainda de palco para um dos maiores acontecimentos históricos de Santa Catarina a "Guerra do Contestado", pois a mesma foi usada para pouso e passagem dos seguidores do Monge São João.
Vale ressaltar ainda que a sede do município era utilizada como cemitério indígena.
Na época de 1859 Chapecózinho era parte do município de Xanxerê o mesmo pertencente a Palmas, estado do Paraná, objeto de disputa entre Paraná e Santa Catarina.
Segundo depoimento recolhido as primeiras famílias que aqui chegaram vieram como aventureiros como é o caso de Cristiano Feliciano dos Santos que chegou aqui como tropeiro e se fixou as margens do Rio constituindo família. Vieram ainda Elias Carneiro, Angelo Narciso, Pedro Florentino Narciso, Manoel Narciso e João Rosa.
A primeira casa comercial do passado surgiu em 1994 pertencente a Angelo Narciso, na qual comercializava todo tipo de mercadoria: (tecidos, chapéus, alimentos, animais de carga, munição, etc.).
Em 1957 foi elevado à categoria de distrito começando sua história político administrativo, com o nome de Bom Jesus, por ser o padroeiro do município de Xanxerê. sendo o mesmo padroeiro de Bom Jesus, tornando-se o 1º Distrito do Município de Xanxerê.
Vale ressaltar, que o distrito de Bom Jesus já teve seus tempos áureos do período de 1957 a 1970 onde a extração de madeira era uma das principais atividades econômicas da região.
Ao findar esse período o distrito experimentou um período de decadência mas que como o empenho dos filhos desses colonizadores acelerou-se a colonização e o desenvolvimento local motivado principalmente pela agropecuária local.
Formação Administrativa:
Distrito criado com a denominação de Bom Jesus, pela lei municipal nº 9, de 07-03-1957, subordinado ao município de Xanxerê.
Em divisão territorial datada de 1-VII-1960, o distrito de Bom Jesus figura no município de Xanxerê.
Assim permanecendo em divisão territorial datada de 17-I-1991.
Elevado à categoria de município com a denominação de Bom Jesus, pela lei estadual nº 9891, de 19-07-1995, desmembrado de Xanxerê. Sede no antigo distrito de Bom Jesus.
Constituído do distrito sede. Instalado em 01-01-1997.
Em divisão territorial datada de 15-VII-1997, o município é constituído do distrito sede.
Assim permanecendo em divisão territorial datada de 2003.
Gentílico: bonjesuense


Fonte: Biblioteca IBGE