O nome do município de Nova Mamoré teve origem do fato circunstancial dos moradores de Vila Murtinho, por necessidade de fugir do isolamento a que foram relegados com a desativação da ferrovia Madeira-Mamoré.
Mudaram para a margem da rodovia BR-425 (Guajará-Mirim/Abunã), o qual denominaram de Vila Nova, provavelmente em alusão à vida nova que iniciavam no local escolhido para fazerem ressurgir a antiga morada que por circunstâncias adversas foram induzidos a abandoná-la.
O povoado expandiu-se rapidamente, tornando-se distrito do município de Guajará-Mirim, para em seguida ser elevado à categoria de município, mantendo o nome de Vila Nova acrescido da localização geográfica, ficando sua denominação oficial Vila Nova do Mamoré.

Fonte: cnm.org.br