São Pedro teve a sua origem em uma propriedade rural pertencente ao Município de Macaíba que, em torno de 1939, já contava com algumas casas residenciais, a Capela de São Pedro, escola rural e pequena feira semanal.
Povoado à margem direita do Rio Potengi, desenvolveu-se estimulado pela rivalidade de seus moradores e os de Pedra Branca, povoação existente na outra margem do mesmo Rio e pertencente a São Gonçalo do Amarante.
Foi desmembrado do Município de São Paulo do Potengi a quem pertencia até a sua emancipação.

Fonte: Biblioteca IBGE